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牧场放养的家禽、猪和肉牛粪肥中的抗生素耐药性、抗生素残留和细菌群落多样性

Michael James Rothrock,Jr,Byeng Ryel Min,Lana Castleberry,Heidi Waldrip,David Parker,David Brauer,Dipti Pitta,Nagaraju Indugu


微生物动物粪肥可能是耐抗生素基因(ARGs)和药物残留的一个来源;然而,很少有研究评估牧场放养动物生产系统中ARG的存在。本研究的目的是检测三个含有不同的动物物种:牧场放养的家禽肉鸡和蛋鸡)、猪和肉牛的农场的微生物群落多样性的变化和抗生素残留(ABRs)的存在。采用16S rRNA微生物组分析测定总的细菌群落,而特异性ARGs(磺酰胺[Sul;Sul1和四环素[Tet;TetA])通过qPCR(real-time PCR)进行计数。

结果表明,蛋鸡粪肥中的ARG丰度(Sul1(P < 0.05)和TetA(P < 0.001))增加了(16.5×10−4和1.4×10−4μg/kg),其次是肉鸡(2.9×10−4和1.7×10−4μ/kg),然后是(0.22×10−4和0.20×10−4μg/kg),最后是肉牛(0.19 × 10−4和0.02 × 10−4 μg/kg)。与其他动物(1.8 ~ 0.06 μg kg−1)相比,肉鸡粪便TetA ABR均值(11.4 μg kg−1)有增加的趋势(P = 0.09);而各种动物间金霉素、林可霉素和土霉素的ABRs是相似的。农场之间以及各物种之间粪便微生物的丰富度和丰度差异极显著(P < 0.01)。

本研究表明,不同农场和不同动物的粪便中微生物多样性、ABR、ARG浓度和类型存在差异。耐药微生物(ARMs)和ARG的水平转移机制有待进一步研究。




2021,JAS,99(8):skab144

https://doi.org/10.1093/jas/skab144


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