猪小肠区域上皮细胞的多样性

Jayne E Wiarda，Sage R Becker，Sathesh K Sivasankaran，Crystal L Loving

了解小肠上皮细胞的区域分布和特化作用对开发控制猪食欲、应激和营养吸收的方法至关重要。为了更好地了解猪小肠不同区域的特异性上皮细胞，我们利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）从十二指肠、空肠和回肠中获得和分析上皮细胞。鉴定的细胞包括隐窝细胞、肠上皮细胞、BEST4肠上皮细胞、杯状细胞和肠内分泌（EE）细胞。

根据EE谱系承诺基因、NEUROD1的表达水平，将EE细胞分为两个亚群。NEUROD1hi EE细胞很少表达激素编码基因，与人类和小鼠的EE细胞不同，表明是猪特有的EE细胞子集。最近发现的BEST4肠细胞通过原位染色在整个小肠的隐窝和绒毛中检测到，不像在人类中，BEST4肠细胞仅在小肠绒毛中发现。通过scRNA-seq观察到EE细胞中激素编码基因和肠细胞中营养转运基因的近端到远端表达梯度，显示出区域特异性。通过定量PCR（qPCR）分析从不同小肠部位上皮细胞中分离的RNA，验证EE细胞和肠细胞的区域基因表达。

虽然在全上皮细胞的qPCR中，许多基因具有相似的区域表达模式，但一些区域表达仅通过scRNA-seq检测到，这突出了scRNA-seq与大样本分析相比，在反褶卷细胞类型特异性区域基因表达方面的优势。总的来说，这些结果为猪小肠上皮细胞的区域定位和转录谱提供了新的信息。

2023，JAS，101：skac318

https://doi.org/10.1093/jas/skac318